深圳灣公園站位于海園二路與濱海大道交匯處,沿濱海大道東西向布置,毗鄰深圳灣濱海公園及紅樹林自然保護區。深圳灣公園站為地下車站,共設有6個出入口。車站設有自助充值機設備,為乘客出行提供便利。車站裝修以綠色為主色調,采用鋁板造型突出重點,整個空間協調統一,本站為地下二層雙島式站臺,4個站臺和3個路軌。